学院拥有江苏省“海洋科学”优势学科（海洋生物资源开发利用方向），江苏省重点学科“生物工程”和校级重点学科“水产品加工”等3个学科。拥有农业硕士（食品加工与安全领域）和生物与医药（食品工程、生物技术与工程领域）专业学位授权点2个。

学院主持建设的生物工程学科2012年获批省“十二五”重点建设学科，2015年以良好成绩通过验收；2016年获批省“十三五”省重点建设学科，2018年以优秀成绩通过中期检查，2021年以优秀成绩通过验收并获批省“十四五”省重点学科。

1.研究方向：

生物工程学科面向国家海洋战略和江苏海洋产业发展重大需求，依托区位和资源优势，经过多年建设，已形成了“食品生物技术与工程”“海洋微生物工程”“海洋酶工程”“海洋生物提取与分离工程”等4个研究方向。

2.学科特色和优势

（1）聚焦江苏海洋生物产业。面向国家海洋战略和江苏海洋经济发展需求，依托海洋生物资源优势，重点开展海洋生物资源开发利用、海洋水产病原微生物防控等方面的应用基础研究，开发新技术、新产品，服务江苏海洋生物产业创新和升级。

（2）高水平学科团队。团队带头人和骨干人员主持多项国家、省部级项目，获得多项高水平成果；高职称、高学历教师占比高，中青年群体发展态势好。

（3）高水平涉海研究成果。依托“江苏省海洋生物资源与环境重点实验室”等多个涉海省级平台，主持7项国家自然基金项目；发表高水平论文37篇（1区论文14篇和2区论文23篇）；在海洋新型酶、海藻活性物质等关键技术取得突破，获得国家海洋科学技术等省部级奖励5项，其中以第一完成单位获得省科技进步三等奖和国家行业协会奖2项；转化成果8项。

3.标志性成果

（1）优质资源。获批省科技厅“江苏省海洋生物资源与环境重点实验室”和省发改委“江苏省海洋生物资源利用与质量安全控制工程中心”等省级科研平台9个。

（2） 创新团队。教授10人，博士34人（35岁以下博士12人）；省“333工程”等省级人才20人次。

（3）人才培养。获批生物与医药（生物技术与工程、食品工程领域）专业硕士点；食品科学与工程专业通过教育部工程教育认证；近3年，生物工程等相关专业平均考研率为27%。

（4）科研创新。主持20项国家、省部级项目，其中7项国家自然基金项目；发表论文159篇，其中SCI论文95篇（1区论文14篇和2区论文23篇）、EI论文5篇、中文核心期刊论文51篇；获得奖励11项；申请国家发明专利52件，授权发明专利39件，国际发明专利1件；转化成果8项。